沙门菌(Salmonella)是肠杆菌科的一种,普遍存在于食源性致病菌中。它是造成急性腹泻的第二大病因,其流行情况在患者、动物及食品领域已得到广泛研究,但在健康人群中的携带与传播监测尚显不足。从“同一健康”(One Health)的视角来看,在病原体及抗药性在动物、环境及人类之间的传播链中,健康人群作为病原体及耐药基因载体的研究尚待深入。
中国疾控中心传染病预防控制所与广西玉林市疾控中心等单位,利用华大智造DNBSEQ测序平台等工具,开展对食品行业从业人员的健康体检,研究沙门菌的携带情况。该研究结合了流行病学、病原学及基因组学,以分析人群中沙门菌的携带率、职业感染的风险及耐药性等关键因素,同时检视克隆群在不同人群中的传播情况。这为监测健康人群中的病原菌及耐药基因组提供了重要的思路,有助于弥补全链条监测的不足。
近期,该研究成果以标题“High carriage and possible hidden spread of multidrug-resistant Salmonella among asymptomatic workers in Yulin, China”在《Nature Communications》上发表。研究表明,健康人群中沙门菌的携带率较高且存在隐匿传播,特别是食品从业人员是从动物或食品传播病原菌及抗药基因的重要环节。研究还发现,尽管社会经济发展降低了非食品从业人员的沙门菌携带情况,但频繁接触食品的从业人员仍需特别关注,提示有必要采取针对性的卫生干预措施。
值得关注的是,由于“中国疾控中心传染病预防控制所”与“广西玉林市疾控中心”实验室早前已建立了完整的高通量测序和数据分析平台,因此该研究能够顺利完成沙门菌的全基因组测序、全基因组多位点序列分型(cgMLST)及耐药基因分析等工作。通过对1,689株耐临床重要抗生素的沙门菌进行基因组测序,研究发现大多数菌株携带抗药基因,且这些基因多位于质粒上,显示出耐药扩散的高风险性。
基于本次研究成果,食源性致病菌的精准鉴定与耐药监测显得尤为重要。在“同一健康”框架下,食源性致病菌的抗药性监测为公共卫生安全提供了科学依据。华大智造利用其先进的全基因组测序工具,为食品安全领域提供精准的致病菌鉴定及毒力基因分析,助力研究与监管的进一步拓展。
作为生物医疗技术的核心提供者,华大智造在全球范围内拥有多种基因测序技术与产品。通过DNBSEQ测序平台及CycloneSEQ纳米孔测序平台的结合,华大智造致力于在食品安全领域的研究与应用,为食源性致病菌的鉴定与溯源工作提供强有力的技术支持。
此次研究由卢昕、罗铭、王梦玉、周哲敏及徐嘉良共同担任第一作者,玉林市疾病预防控制中心的吴炎农与中国疾控中心的多位专家为共同责任作者。有关进一步的科学研究和监测任务,将持续推动食源性致病菌的公共健康管理。
俄罗斯专享会294倡导生物医疗领域的研究与交流,借此平台推动创新与技术的应用,以保障公众健康。