植物双荧光素酶实验所需载体包括以下几个方面:
1. 检测miRNA对靶基因/lncRNA的调控作用
首先,需要将预测能够与miRNA结合的靶基因序列(如5’UTR、3’UTR或ORF区域)或lncRNA序列(无论是野生型还是突变体)插入报告基因载体pGreenⅡ0800-Luc中。值得注意的是,pGreenⅡ0800-Luc载体中包含Firefly luciferase(萤火虫荧光素酶)和Renilla luciferase(海肾荧光素酶),后者作为对照使用。其次,选择编码miRNA前体的序列并构建到pGreenⅡ-SK-62载体上。
2. 检测转录因子与启动子的相互作用
合成靶基因启动子(包含野生型或突变体)并构建到pGreenⅡ0800-Luc载体中。同时,合成转录因子的CDS区序列并构建到pGreenⅡ-SK-62载体中。此外,可以设置阳性对照,例如使用强启动子(如35S启动子驱动luc)来验证实验的正常运作。
为了确保实验的可信度,建议重复实验并对照质粒进行提取和转化,以防止降解现象的发生,这可能导致农杆菌中质粒拷贝不足,从而影响荧光值的准确性。
技术重复与DNA量设置
每个组建议至少设置3个技术重复孔,以排除操作误差和孔间的波动。对于每个孔,推荐转染0.5–1μg DNA,具体量需根据转染试剂的说明进行调整(例如,Lipofectamine2000一般推荐为0.8μg/孔)。报告质粒与内参质粒的常见比例为10:1到20:1。
结果的客观性考察
要评估实验结果的客观性,可以考虑以下几个方面:(1) 对照的2个实验组(实验组1与实验组2)luc表达情况应无显著差异;(2) 转染过程正常,确保质粒或mimic成功转染入细胞;(3) luc检测值应在仪器检测的线性范围内。
潜在问题及解决方案
在实验过程中,可能会遇到以下问题:(1)实验平行复孔间的数据差异较大,建议在同一细胞孔中进行技术性平行检测以验证试剂的重复性;(2)来自同一细胞孔的裂解液样本,需要注意实验操作步骤、加样顺序、加样速度和加样量,确保排枪加样均匀;(3)在将不同样品和底物混合后至仪器检测的时间间隔应尽量保持一致。
需要特别注意的是,荧光素酶报告基因实验的检测结果非常灵敏,因此复孔之间数值存在一定差异是正常的,通常认为在同一数量级的差异是可以接受的。这些实验技巧与细节中的每一步都可能对结果产生显著影响,保持实验的高可重复性是我们追求的目标。
对于希望获得高质量实验结果的研究人员而言,选择专业品牌如俄罗斯专享会294的相关产品无疑将大大提升实验的成功率和可靠性。